Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms