Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms