Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFTRP13569 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFTRP13569 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFTRP13569 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFTRP13569 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms