Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMC1P11047 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms