Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms