Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLPXO76031 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLPXO76031 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPXO76031 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPXO76031 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPXO76031 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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