Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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