Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms