Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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