Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFGEF2Q9Y6D5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms