Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms