Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms