Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms