Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms