Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX7Q9UNH6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms