Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms