Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms