Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms