Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms