Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms