Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A12Q9NXJ0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms