Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms