Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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TDP1Q9NUW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TDP1Q9NUW8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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