Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms