Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms