Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms