Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms