Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms