Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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