Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms