Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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