Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms