Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms