Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC114Q96M63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms