Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms