Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms