Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms