Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms