Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms