Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERPINA11Q86U17 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms