Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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ATG4DQ86TL0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ATG4DQ86TL0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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