Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APTXQ7Z2E3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms