Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms