Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MFSD6Q6ZSS7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms