Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms