Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms