Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms