Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C10orf55Q5SWW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms