Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms