Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC23Q53EV4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms